--- --- 第8回 Biomedical Linked Annotation Hackathon (BLAH8) 開催案内・プロジェクト提案募集中 | DBCLS

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第8回 Biomedical Linked Annotation Hackathon (BLAH8) 開催案内・プロジェクト提案募集中

2023. 10. 03  /

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DBCLSは、生命科学分野における生物医学情報のテキストマイニングにフォーカスした国際ハッカソン「第8回Biomedical Linked Annotation Hackathon（BLAH8）」を2024年1月に千葉県柏市で開催します。

第8回 Biomedical Linked Annotation Hackathon (BLAH8)

https://blah8.linkedannotation.org/

開催概要

開催趣旨

BLAHは生物医学文献のアノテーションとマイニングのためのリソースを連携してシェアすることで研究分野を活性化し、オープンな国際協力関係を築くことを目的としたハッカソンイベントです。ここでいうリソースにはコーパス、アノテーションデータセット、データベース、言語モデル、ツール、ウェブサービス、語彙、オントロジー、可視化手法など広い範囲を含みます。 残念ながらコロナ禍により休止を余儀なくされておりましたが、BLAH8として再開いたします。近年の大規模言語モデル（LLM）の発展を受け、BLAH8では「Biomedical Annotations in the Age of LLM」をテーマとして掲げました。このテーマはコミュニティの最新の焦点であり、生物医学分野における技術的進歩の最前線に立ち続けるというコミットメントを示すものです。BLAH8を通して、LLMと文献アノテーションの潜在的な相乗効果を探求し、生物医学アプリケーションの様々な側面を深く掘り下げていきたいと考えています。

ハッカソンプロジェクト募集

ハッカソン期間中に行うプロジェクト提案を募集します。特に今回はLLM関連のプロジェクトを歓迎します。テーマは以下を含みますが、これに限らず、生物医学文献アノテーションに貢献できるプロジェクトを広く募集いたします。

＊　アノテーションリソースの統合
＊　アノテーションリソースの評価
＊　応用

  • プロジェクト提案申し込みURL: https://blah8.linkedannotation.org/calls
  • 申し込み締め切り: 2023年10月21日 (土) 午後9時
    • 提案されたプロジェクトについてプログラム委員会で簡単な審査を行い、2023年10月30日までに採否をお知らせいたします。プロジェクト提案をされる方には、プロジェクトのホームページ等の準備をお願いすることになります。申し込み確認のメールが送られますので、そのメールに従ってください。

参加登録

プロジェクト提案なしでも、参加のみの登録も可能です。

  • 参加登録URL: https://blah8.linkedannotation.org/registration
  • 参加登録締め切り
    • プロジェクト提案がある場合: 2023年10月21日 (土) 午後9時
    • 提案がない場合: 2023年12月1日 (金) 正午 （会場の収容人数に空きがあればこれ以降も登録を受け付けますが定員になり次第予告なく締め切ります。）

論文出版について

BLAH8終了後、参加者は以下の2つのいずれかに、ハッカソンの成果報告などの論文を投稿することができます。

  • Genomics & Informatics：PubMedにインデックスされたオープンアクセスジャーナルで、掲載された論文は直ちにPMCオープンアクセスサブセットに含められます。投稿料は無料です。
  • BioHackrxiv： OSF preprintsを利用し、EuropeanPMCがインデックスを作成するプレプリントサーバーです。

多くのご応募をお待ちしております。 ご不明の点は blah8-oc@linkedannotation.org までお問い合わせください。